魚の陸上進化 – Kim Biology & Informatics

肺の起源と進化について

Kim 2025年2月23日 2025年2月23日生物, 魚の陸上進化 0

我々陸上脊椎動物は基本的に肺を通じた呼吸を行っている。ヒトのみならず、霊長類やイヌ・ネコを含めた哺乳類、クジラやイルカなどの海獣も肺呼吸を行っている。一方、(一般的な)魚やホヤ、ナメクジウオといった一部の脊索動物では肺呼吸を行わず、エラ呼吸を行う。それでは、肺の起源と進化はいつ頃、どのようにして起…

脊椎動物最大！ハイギョのゲノム決定 (ハイギョ解説)

Kim 2024年10月5日 2024年10月25日生物, 魚の陸上進化 2

2024年10月13日追記: イモリのゲノムについてハイギョという魚は、通常の魚と同様にエラ呼吸をすることに加え、肺呼吸することができる。我々は肺呼吸しかできないが、祖先をたどると、デボン紀頃、エラ呼吸だけをしていた魚から肺呼吸をする魚が出現した。現生の魚で肺呼吸を残しているのはハイギョという魚…

The bichir handbook について

Kim 2023年11月15日 2023年12月8日生物, 魚の陸上進化 0

2020年に海外で “The bichir handbook” というポリプテルスの書籍が出版された。日本でも少し話題になり、個人輸入した人がメルカリに出品するなど、ちらほら入手している人もいるようだった。私も海外から取り寄せた(冊数が足りなかった上に遅かったりだいぶ苦労…

アフリカハイギョのシングルセルトランスクリプトームから魚の陸上適応を明らかにする

Kim 2023年9月14日 2024年8月16日RNA-seq, 魚の陸上進化, 生物, バイオインフォマティクス 0

　ハイギョは現生魚類の中で最も陸上脊椎動物(両生類や有羊膜類など)に近い生物である。その名の通り肺を持っている魚である。エラも持っており、エラと肺、両方で呼吸ができる特殊な魚である(他にもポリプテルスなどが同様に肺とエラ両方持っている)。　また、一部のハイギョでは水が干上がった乾季などにおいては泥…

ハイギョの繭は生きた細胞で、外環境から身を守る

Kim 2021年12月20日 2025年2月23日生物, 魚の陸上進化 0

ハイギョは最も両生類に近い、現在生きている魚である。「生きた化石」とも呼ばれ、またその名の通り肺を持つ魚としても知られている。肺を持つ、ということは空気呼吸が可能であり、陸上で生活できることが知られている。実際、アフリカや南アメリカに生息するハイギョは陸上で生き延びることができ、乾季になると土…

外鰓とは何か？ – 進化的起源と役割

Kim 2021年3月19日 2023年11月27日生物, 魚の陸上進化 0

ウーパールーパーという両生類がいる。英名はアホロートルというのだが、日本では何故か「ウーパールーパー」と名付けられたというかわいそうな(かわいい)生物である。さて、動物園や水族館、そしてお父さんお母さん世代の人気者であったウーパールーパーの特徴はなんと言ってもその「外鰓」である。あのビラビラした顔…

【速報】ポリプテルスとアフリカハイギョのゲノム解読

Kim 2021年2月5日 2023年11月27日生物, 魚の陸上進化 0

ポリプテルスゲノム 2021年2月4日付で、Cell誌にポリプテルス・セネガルス、アリゲーターガー、ヘラチョウザメ、アミア・カルヴァなどのいわゆる「下位条鰭類」「古代魚」のゲノムが解読されたという論文が掲載された。 Tracing the genetic footprints of vertebra…

【脊椎動物最大級】魚から両生類への進化を解明？ハイギョのゲノムがついに解読

Kim 2021年1月19日 2024年8月16日生物, 魚の陸上進化 0

英時間2021年1月18日にNatureにオーストラリアハイギョのゲノムが解読されたという内容の論文が発表された。 Meyer, A., Schloissnig, S., Franchini, P. et al. Giant lungfish genome elucidates …

魚と両生類の間 – 現在生きている魚と比較して

Kim 2020年9月9日 2023年11月27日生物, 魚の陸上進化 0

私は魚と両生類の間でどのような進化が起きたのかを研究しているのだが、私と同じような興味を抱いている人間は一般の人にも多く、度々「魚の手足の起源！」「両生類に似た魚！」みたいな話がニュースサイトに取り上げられるたびにTwitterなどで少し話題になったりする。最近だとNatureに掲載された&#82…