なぜ近親交配が禁じられるのか？ – 近交係数の計算
はじめに(人間のはなし) 日本に関わらず世界において，近親相姦・近親婚はタブー視されている． 例えば日本では，近親相姦や近親間での事実婚は法律上阻害されるようなことはないが，婚姻届を出すことができない．親子，きょうだい，”おじ”と”めい”などがそれに当…
【Tips】GPyでグラフをプロットしたときmeanやconfidenceなどが表示されない
問題点 GPyでグラフをプロットしたとき，Dataのみはプロットされるものの，meanやconfidenceなどの線や範囲が表示されないことがあった． 解決法 入力するデータにNaN(欠損値)が含まれている場合そのようなことが起きる． 必ずすべてのNaN(欠損値)を除外した上でデータを渡さなければな…
ポリプテルスを陸上で飼育する方法
はじめに 数年前，ポリプテルスが陸上飼育を長期間行うことで歩行パターンが変化し，胸鰭を支える骨格において可塑的な変化が生じるという論文が発表された． Standen, E. M., Du, T. Y., & Larsson, H. C. (2014). Developmental plast…
【Python】GPyでガウス過程回帰と予測をやってみる
はじめに ガウス過程回帰とは，線形回帰ではフィッティングできないようなものであってもより有効な非線形回帰モデルの1つである． 説明変数xを入力として，目的変数yを導き出す． 詳しい説明は以下の文献を参照して欲しい．(ぶっちゃけ私は詳しいガウス過程回帰の仕組みとかよくわかっていない．「こういうのがある…
ウナギやポリプテルスの特殊な鼻！～魚の鼻の穴は計4つ？～
今回の内容は『ポリプテルスやウナギなどの一部の魚における嗅覚器の構造』だ．具体的には鼻管および鼻腔内の水流機構について軽く触れる． 鼻管について ポリプテルスやウナギを飼っている人，もしくは水族館でウツボとかが好きなマニアックな人間なら誰しも一度は「あの鼻」がなんであるのか疑問に思ったことがあるはず…
なぜ動物の交尾はバックばかり？～魚の妊娠の起源から陸上四肢動物まで～
WordPressでサイトの作成を行っているのだが，「どのような検索がされたのか」というところを眺めていたところ「 なぜ動物はバックばかり？ 」という検索履歴を見てしまった 確かに我々人間からしてみれば他の動物の交尾時における体位多様性の無さに疑問を覚えるのかもしれない(ヒトが異常なだけだが) 例え…
OpenPose for Unity で人の動きを二次元に落とし込む
関連記事 Ubuntu18.10にopenposeをインストール(環境構築) OpenPoseのJSON形式をCSVに変換する 前提条件および目的 上記のようにOpenPoseがインストールされている状態が前提． この記事が参考になる 【2019.4最新】UnityでOpenPoseが使えるまでのイ…
ケラチンの進化が陸上生活を可能にさせた？
「ケラチン」と聞いて何を思い浮かべるだろうか． 聞いたことがある，という人はおそらく髪の毛や爪を想像するだろう． その通り髪の毛や爪に含まれる「細胞骨格」の一種，中間径フィラメントであるケラチンは進化的にも非常に面白いタンパク質である． あんまり一般的に馴染みがないのか，髪の毛の成分であるにもかかわ…
ポリプテルスの飼い方
ポリプテルスが今密かにアクアリストの中でブームになっています． ポリプテルスが「発見(記載)」されたのはかのナポレオンの時代 ナポレオンがエジプト遠征に行ったときにキュビエがポリプテルスを持ち帰り，新種として記載されたことが人類の文献におけるポリプテルスの最初の登場です．2019年現在でもポリプテル…
【BLAST】tblastnで Could not calculate ungapped Karlin-Altschul parameters due to an invalid query sequence or its translation. Please verify the query sequence(s) and/or filtering options と出る
アホみたいなミスをして時間を溶かしたので万が一こんなエラーで悩んでいる一のための備忘録 問題点 makeblastdbでデータベースを作成後，クエリーとしてとあるmRNAの配列を用意し，tblastnにかけた． その結果，Could not calculate ungapped Karlin-Alt…
![【Qiskit】マルチオミクス解析を量子機械学習でやる①[環境構築・基礎]](https://kimbio.info/wp-content/uploads/2024/05/2203027-100x100.jpg)
