【Python】GPyでガウス過程回帰と予測をやってみる
はじめに ガウス過程回帰とは，線形回帰ではフィッティングできないようなものであってもより有効な非線形回帰モデルの1つである． 説明変数xを入力として，目的変数yを導き出す． 詳しい説明は以下の文献を参照して欲しい．(ぶっちゃけ私は詳しいガウス過程回帰の仕組みとかよくわかっていない．「こういうのがある…
投稿者: Kim
ウナギやポリプテルスの特殊な鼻！～魚の鼻の穴は計4つ？～
今回の内容は『ポリプテルスやウナギなどの一部の魚における嗅覚器の構造』だ．具体的には鼻管および鼻腔内の水流機構について軽く触れる． 鼻管について ポリプテルスやウナギを飼っている人，もしくは水族館でウツボとかが好きなマニアックな人間なら誰しも一度は「あの鼻」がなんであるのか疑問に思ったことがあるはず…
なぜ動物の交尾はバックばかり？～魚の妊娠の起源から陸上四肢動物まで～
WordPressでサイトの作成を行っているのだが，「どのような検索がされたのか」というところを眺めていたところ「 なぜ動物はバックばかり？ 」という検索履歴を見てしまった 確かに我々人間からしてみれば他の動物の交尾時における体位多様性の無さに疑問を覚えるのかもしれない(ヒトが異常なだけだが) 例え…
OpenPose for Unity で人の動きを二次元に落とし込む
関連記事 Ubuntu18.10にopenposeをインストール(環境構築) OpenPoseのJSON形式をCSVに変換する 前提条件および目的 上記のようにOpenPoseがインストールされている状態が前提． この記事が参考になる 【2019.4最新】UnityでOpenPoseが使えるまでのイ…
ケラチンの進化が陸上生活を可能にさせた？
「ケラチン」と聞いて何を思い浮かべるだろうか． 聞いたことがある，という人はおそらく髪の毛や爪を想像するだろう． その通り髪の毛や爪に含まれる「細胞骨格」の一種，中間径フィラメントであるケラチンは進化的にも非常に面白いタンパク質である． あんまり一般的に馴染みがないのか，髪の毛の成分であるにもかかわ…
ポリプテルスの飼い方
ポリプテルスが今密かにアクアリストの中でブームになっています． ポリプテルスが「発見(記載)」されたのはかのナポレオンの時代 ナポレオンがエジプト遠征に行ったときにキュビエがポリプテルスを持ち帰り，新種として記載されたことが人類の文献におけるポリプテルスの最初の登場です．2019年現在でもポリプテル…
【BLAST】tblastnで Could not calculate ungapped Karlin-Altschul parameters due to an invalid query sequence or its translation. Please verify the query sequence(s) and/or filtering options と出る
アホみたいなミスをして時間を溶かしたので万が一こんなエラーで悩んでいる一のための備忘録 問題点 makeblastdbでデータベースを作成後，クエリーとしてとあるmRNAの配列を用意し，tblastnにかけた． その結果，Could not calculate ungapped Karlin-Alt…
魚が陸に上がるとき 〜最初は口で空気を吸わなかった？〜
魚陸上化関連記事 シーラカンスは陸に上がったのか？ 魚が陸に上がるとき 〜尿素代謝〜 古代の魚の呼吸事情 古代、デボン紀あたりの魚は低酸素の水の中でも生きられるように肺を獲得してきたと言われている。 今、私たちヒトは口と鼻で空気を吸うことができ、基本的に陸上四肢動物においては口を通じて主に呼吸を行っ…
シーラカンスは陸に上がったのか？
はじめに 先日の某学祭においてシーラカンスの解説員を勤めていた． すずかけ台キャンパスの博物館にはこんな感じのシーラカンスの模型(レプリカ)が展示されているのだが，一般客には「すごい」「でかい」となかなかに好評であった． ただパネルをじっくり読むような人でなければ「シーラカンスはでかい魚」で終わりな…
CPSIIIの進化の話
クララのCPS I-likeな酵素 前回の記事でCPS(Carbamoyl phosphate synthetase; カルバモイルリン酸シンターゼ)の進化について少しまとめた． 記事中で， アンモニアを基質とするCPS Iを持つようになったのがハイギョ以降、つまり肉鰭類のうち陸上に上がった/上がる…
