【Python】scipy.statsを使って正規分布の累積分布関数をプロットする
あまり調べても出てこなかった上に，いちいちPython上でライブラリを使わず積分して求めるやり方とかが出てくるので覚え書きとして． 一般的に我々がよく目にする正規分布のあの釣鐘状のグラフは確率密度関数をプロットしたものである．それのプロットの仕方はそこら中に出回っているのでそちらを参照してほしい． …
タグ: Python
ラズパイとSlackで自宅水槽監視 – Pythonで自動投稿
前回の記事の続きであるので読んでない人は先にそちらを読むことをおすすめする． ラズパイとSlackで自宅水槽監視 – 初期設定 ラズパイ起動時に自動起動 Raspberry Piが起動したときにmotionを自動起動させたい． そこで/etc/rc.localをいじる． これで開かれるファイルの末尾…
なぜ動物の性比は1:1なのか？- 個体ベースPythonシミュレーションで見る
さて，前回の話の続き． (なぜ動物の性比は1:1なのか？-フィッシャーの原理) 前回は”概念”的な話と数式を用いた解説を行った． それにより「両親から同じ数の遺伝子を受け継ぎ生涯性別が固定されている有性生殖をする動物」については性比がおおよそ1:1になることがわかっただろう．…
【Python】Matplotlibで複数のグラフを一枚の画像で表示
環境 Jupyter Notebook 5.7.1 matplotlib 2.2.2 導入 複数のグラフを一枚の図に入れて編集の手間を省こうと思った。 コード (参考:Matplotlibで複数のグラフを並べて描く方法) 6つグラフを表示し、1～5はhogeXで6つ目はPopulationである。 …
Python for Biologists を終えて
バイオインフォマティクス学習者向けのPythonの本として「Python for Biologists」という本がある。 現時点として日本語に翻訳はなされていないが、平易な英文で書かれているため、大学学部程度の学力があれば普通に読むことができる。 以下のURLから購入することができる。 htt…
【Python】mRNAからタンパク質に翻訳するための辞書
コドン表のCSVやPython用辞書、ありそうで探した時ぱっと見当たらなかったので置いておく。 普段あまり使う機会はないと思うが、学習用に。 ・CSV codon_table.csv ・Python用コドン表辞書 codon_table = { ‘AUA’:’I’, ‘AUC’:’I’, ‘A…
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