遺伝研スパコンのジョブの終了状態を確認する
遺伝研スパコン(遺伝研スーパーコンピュータシステム)では、Grid Engine (SGE系)を採用している。この記事を読んでいる人(利用者)であれば、まず最初にqloginしろ、とか、ジョブを実行するときはスクリプトファイルをqsubしろ、とかを講習会などで最初に習うはずである。 無事終了する…
タグ: Linux
bioawk で multiple FASTA の配列長を取得
参考: Sequence length from Fasta マルチFASTA で、それぞれの配列の長さを出してほしい時がある。 そういったときに簡単に出力してくれるのがbioawkだ。 で、仮想環境上にインストール。 で、出力してくれる。 全部出すと長い場合、パイプで繋いでやって欲しい部分に絞って…
Windows上でUbuntu(WSL)を動かしたときにエンターキーで変な文字が入力される
問題点 こんな感じでWSLを起動して入力をし、Enterキーを押すと”^[[F”が入力されてしまう。 これによってパスワードなどの設定がうまくいかない。 解決方法 なぜかは不明だが、管理者権限で実行するとその問題が起こらない
Ubuntu18.10にopenposeをインストール(環境構築)
Ubuntu18.10にOpenPoseをインストールするのになんかいろいろ手こずったためメモとして残しておく。 環境 CPU: Intel Core i7-8700 メモリ: 32GB グラボ: RTX2080 OS: Ubuntu18.10 desktop ちなみにグラボからの映像出力は行ってい…
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