バイオインフォマティクス – ページ 7

【Python】mRNAからタンパク質に翻訳するための辞書

Kim 2018年9月18日 2018年11月11日Python, バイオインフォマティクス 0

　コドン表のCSVやPython用辞書、ありそうで探した時ぱっと見当たらなかったので置いておく。　普段あまり使う機会はないと思うが、学習用に。・CSV 　codon_table.csv ・Python用コドン表辞書 codon_table = { ‘AUA’:’I’, ‘AUC’:’I’, ‘A…

Kim 2018年1月17日 2022年10月19日バイオインフォマティクス 3

　最近courseraのmachine-learningという講義を取り始めた．　バイオインフォマティクスの勉強をやっていくうちに何かもっとゲノム全体で大きく広く解析が自動で行われないかと考えていたところ，最近流行りの機械学習やディープラーニング，AIという単語が脳裏に浮かんだ．　愚直ながらもそ…

Kim 2017年8月10日 2018年11月11日バイオインフォマティクス 0

　だいぶ苦戦したので忘備録として．　BioLinuxの最新版(Ubuntu14.04)においてグラフィックボードを使用した際に画面が点滅，及び正常に描写されないといった現象が確認された．　使用していたグラボはZOTAC ZT-70406-10P GeForce GTX760であった．　Wind…

Kim 2017年5月10日 2018年11月11日バイオインフォマティクス 0

　PyMOLにおけるポリペプチド鎖二面角の求め方を備忘録として記しておく．　まずペプチド結合について軽く触れておくと，ペプチド結合は共鳴によって約40%の二重結合性を帯びている(LinusPauling and RobertCorey)．　そのことからペプチド結合は平面構造を取る．つまりポリペプ…