枝が長い系統樹の注意点 – Long Branch Attraction
分子系統樹を作成する時、特に何も考えずにツールに突っ込んで得られたデータの樹形を見ているということはないだろうか？ 系統樹に関する既知の問題点として「Long branch attraction」という現象が古くから(50年くらい前)知られている。ロングブランチアトラクション、の日本語訳はまだ当てら…
カテゴリー: 分子進化(理論)
中立進化説をわかりやすく
木村資生（きむらもとお）が定式化した分子進化生物学で最も有名かつ基本的な概念、「中立進化説」についてざっくりと一般向けに解説を行う。 分子進化生物学における進化とは？ 遺伝子(あるいはゲノム)の塩基配列の変化、というのが進化を最も端的に表す言葉となる。ここでは簡単のため、タンパク質に翻訳される遺伝子…
なぜ近親交配が禁じられるのか？ – 近交係数の計算
2020/10/15 不適当な説明を修正2020/11/16 微妙な表現を修正 はじめに(人間のはなし) 日本に関わらず世界において，近親相姦・近親婚はタブー視されている． 例えば日本では，近親相姦や近親間での事実婚は法律上阻害されるようなことはないが，婚姻届を出すことができない．親子，きょうだい，…
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