分子進化(理論) – Kim Biology & Informatics

DNAの突然変異と量子効果について

Kim 2024年4月13日 2024年4月13日分子進化(理論), 生物 0

我が地球上の生命の進化の原動力はDNAの点突然変異によるものである。ではその突然変異はどのようにして引き起こされるのだろうか？　高校や学部生の教科書的には「DNA複製時に極めて低い確率で起こる」と書かれているが、直接的な要因について触れているものはない。 DNAの二重らせん構造を発見・提唱したワトソ…

「最も古い」現生動物は何か？― カイメンとクシクラゲ論争

Kim 2024年2月18日 2024年2月18日分子進化(理論), 生物 0

　色々と系統樹について勉強していく人はきっと「最も系統樹を遡っていった先にある生物はなんだろう？」と考えるだろう。生物全般についていえば、これはLUCA (The last universal common ancestor)と呼ばれる(仮説上の)生物にあたる。　すべての生物の共通祖先でなくとも、…

枝が長い系統樹の注意点 – Long Branch Attraction

Kim 2021年7月9日 2023年11月27日分子進化(理論), 生物, バイオインフォマティクス 0

分子系統樹を作成する時、特に何も考えずにツールに突っ込んで得られたデータの樹形を見ているということはないだろうか？系統樹に関する既知の問題点として「Long branch attraction」という現象が古くから(50年くらい前)知られている。ロングブランチアトラクション、の日本語訳はまだ当てら…