アホみたいなミスをして時間を溶かしたので万が一こんなエラーで悩んでいる一のための備忘録
問題点
makeblastdbでデータベースを作成後，クエリーとしてとあるmRNAの配列を用意し，tblastnにかけた．
その結果，Could not calculate ungapped Karlin-Altschul parameters due to an invalid query sequence or its translation. Please verify the query sequence(s) and/or filtering options というエラーメッセージが出る．
解決策
クエリーは塩基配列であり，アミノ酸配列でなかった．
tblastnはアミノ酸配列をクエリーとする検索(データベースを6通りのアミノ酸配列に変換してから相同性検索をする)であるので，そもそもtbalstnを使っているのが間違い．
tblastxが正解．
動いた．
終わり．
