codemlのCodonFreqの選択について Kim 2022年11月11日 2023年11月27日バイオインフォマティクス 淘汰圧解析, バイオインフォマティクス, 配列解析, codeml, PAML 0 選択圧(淘汰圧)を解析するためにPAMLのcodemlがよく使われる。 いくつか日本語でも解説が書かれており、それに従って使っていることが多かったが、CodonFrequencyについての記述は日英共に解説が少ない。どうやって選択すべきか調べていたが、灯台もと暗しで知人がきちんと統計的なモデル選択の… Continue reading