SRA Toolkitの使い方 ~fastq-dumpでSRAファイルをダウンロード~ Kim 2019年11月7日 2023年11月27日SRAtoolkit, バイオインフォマティクス バイオインフォマティクス, SRA Toolkit, RNA-seq 3 前回のSRA toolkitの記事から結局一年近くが経ってしまった……実際にRNA-seq のデータ解析を始めようと思うのでこの際自分の備忘録および後輩たちへのドキュメントとして今回書き留めていこうと思う。 SRAファイルの中身を見る 結局今現在、SRAファイルはNCBIから直接ダウンロードは出来な… Continue reading
SRA Toolkitの使い方 ~ インストールと設定 ~ Kim 2018年9月26日 2022年10月19日SRAtoolkit, バイオインフォマティクス バイオインフォマティクス, ゲノム解析, SRA, SRA Toolkit 0 はじめに(SRAとは) これから何回かに分けて自分で学びながら忘備録としてSRA Toolkitの使い方を残しておこうと思う。 SRA(Sequence Read Archive)を解析する方法として、SRA Toolkitを使う方法がある。というか、使わざるを得ない状況になってきている。 2022… Continue reading